7. Neformální proteomické setkání

Již tradiční, 7. Neformální proteomické setkání pro vás tentokrát v Hradci Králové organizuje Proteomická sekce České společnosti pro biochemii a molekulární biologii.

Neformální proteomické setkání je národní konferencí, ale zároveň i neformálním prostorem k seznámení jednotlivých proteomických skupin, k navázání pracovních i osobních kontaktů s dostatečným prostorem k diskusi o proteinech, proteomice a životě.

Součástí konference bude vyhlášení vítězů a předání Ceny Josefa Chmelíka za nejlepší české proteomické publikace zveřejněné v roce 2019 a 2020. Sponzorem tohoto ocenění je firma Amedis, autorizovaný distributor přístrojů firmy SCIEX. V letošním roce jsou součástí setkání také čtyři edukativní firemní workshopy.

Organizace setkání v tradiční a dobře osvědčené podobě by nebyla možná bez podpory sponzorů:

• Amedis/Sciex
• Bruker
• Eppendorf
• MERCK
• Phenomenex
• Pragolab/Thermo Scientific

CZ Proteo: Sponzoři 7. Neformálního proteomického setkání

Firemní workshopy

Mimo hlavní program setkání proběhnou čtyři edukativní firemní workshopy. Firemní workshopy se konají ve spojených učebnách 1 a 2 hned u konferenčního sálu. Na firemní workshopy se registrujte přes registrační formuláře pořadatelů.

Proteome Discoverer v. 2.5

• Michaela Ščigelová (Thermo Fisher Scientific/Pragolab)
• čtvrtek 25.11. 10:00 - 12:00

Improving Nano LC-MSMS Data Quality Using Trap and Elute Methodologies

• Sergio Guazzotti (Phenomenex)
• čtvrtek 25.11. 16:40 - 17:30

Electron Activated Dissociation combined with Zeno Trap Pulsing Q-TOF system in protein analysis

• Tomáš Korba (AMEDIS)
• čtvrtek 25.11. 17:30 - 18:10

Live from the lab: real-time proteomics data procession with PaSER on the timsTOF Pro 2

• Gary Kruppa (Bruker Daltonics)
• pátek 26.11. 8:30 - 9:30

Program 7. Neformálního proteomického setkání

Čtvrtek 25. listopadu

10:00 - 12:00 Firemní workshop: Proteome Discoverer 2.5 (pro registrované)

• Michaela Ščigelová (Pragolab/Thermo Fisher Scientific)

12:30 - 13:00 Příchod a potvrzení registrace

13:00 - 13:10 Zahájení

• Petr Novák, Juraj Lenčo

13:10 - 14:55 První odpolední blok (předsedající: Pavel Bouchal)

13:10 P01: Retrovirus-host interplay elucidated by mass spectrometry approaches

• Petra Junková (Ústav organické chemie a biochemie AV ČR)

13:30 P02: Má Bordetella paměť?

• Denisa Petráčková (Mikrobiologický ústav AV ČR)

13:50 M01: Proteomická analýza srdečních komor při chronickém srdečním selhání

• Matěj Běhounek (1IOCEV, 1.LF, Univerzita Karlova)

13:58 M02: Obézní sprinteři na drahách rezistence. LFQ analýza K562 buněk rezistentních na TKI imatinib

• Ondřej Toman (Proteomické oddělení, Ústav hematologie a krevní transfuze)

14:06 M03: Proteomic analysis of Vernix caseosa

• Adéla Pravdová (Institute of Organic Chemistry and Biochemistry of CAS/Department of Analytical Chemistry, Faculty of Science, Charles University)

14:14 M04: Study of the substrate repertoire of the intramembrane protease RHBDL4 using SILAC labelling and SDS PAGE pre-fractionation

• Alena Křenková (Institute of organic chemistry and biochemistry AS CR)

14:22 M05: Increased dynamic range in mouse plasma samples using BoxCar acquisition

• Thomas Stehrer (Proteomics Service Laboratory, Institute of Physiology, Czech Academy of Sciences, Prague)

14:30 F01 Firemní přednáška: Leveraging the Power of Core-Shell Particles to Improve Nano LC Separations in Proteomics

• Sergio Guazzotti (Phenomenex)

14:55 - 15:15 Přestávka na kávu

15:15 - 16:20 Druhý odpolední blok (předsedající: Jiří Petrák)

15:15 - 15:20 Vyhlášení vítězů Ceny J. Chmelíka

15:20 P03 Oceněný/á za rok 2019

15:40 P04 Oceněný/á za rok 2020

16:00 P05 Oceněný/á za rok 2020

16:20 - 16:40 Přestávka

16:40 - 17:30 Firemní workshop: Improving Nano LC-MSMS Data Quality Using Trap and Elute Methodologies (pro registrované)

• Sergio Guazzotti (Phenomenex)

17:30 - 18:10 Firemní workshop: Electron Activated Dissociation combined with Zeno Trap Pulsing Q-TOF system in protein analysis (pro registrované)

• Tomáš Korba (Amedis/SCIEX)

18:30 Večeře v restauraci U děravýho kotle (pro registrované)

Pátek 26. listopadu

08:30 - 9:30 Firemní workshop: Live from the lab: real-time proteomics data procession with PaSER on the timsTOF Pro 2 (pro registrované)

• Gary Kruppa (Bruker)

9:30 - 9:35 Krátká přestávka

9:35 - 10:51 První dopolední blok (předsedající: Marek Vrbacký)

09:35 P06: Využití funkcionalizovaných MALDI povrchů v klinické diagnostice

• Petr Pompach (Mikrobiologický ústav AVČR/Biotechnologický ústav)

09:55 P07: Mass spectrometry-based protein assays to characterize neural tissue cytoarchitecture

• Zdeněk Spáčil (RECETOX, Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita)

10:15 P08: Bottom-up, middle-up a intaktní LC-MS analýzy protilátkových bioléčiv pomocí jediné kolony

• Juraj Lenčo (Katedra analytické chemie, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové, Univerzita Karlova)

10:35 M06: Knihovna cílených hmotnostně-spektrometrických assays pro proteotypovou klasifikaci trojitě negativních nádorů prsu získaná pomocí timsTOF Pro

• Petr Lapčík (Ústav biochemie, Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita, Brno)

10:43 M07: Proteotypová analýza renálního karcinomu ve vztahu k prognóze a terapeutické odpovědi

• Pavel Bouchal (Ústav biochemie, Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita, Brno)

10:51 - 11:15 Přestávka na kávu

11:15 - 13:20 Druhý dopolední blok (předsedající: Marek Šebela)

11:15 F02 Firemní přednáška: Latest developments in 4D-Proteomics: Single cell proteomics, and CCS-aware informatics

• Gary Kruppa (Bruker)

11:40 P09: Rychlá fotochemická oxidace proteinů: strukturní studie hemoglobin-haptoglobinového komplexu pomocí timsTOF Pro

• Petr Novák (Mikrobiologický ústav AV ČR)

12:00 P10: First Year of Hydrogen-Deuterium Exchange at IOCB: The effect of domain order on fusion two-domain proteins structure

• Jakub Sýs (Mass Spectrometry, Institute of Organic Chemistry and Biochemistry of the Czech Academy of Sciences)

12:20 P11: The use of mobile phase with low formic acid concentration in LC-MS proteomic analysis leads to enhanced electrospray ionization and improved sensitivity

• Siddharth Jadeja (Department of Analytical Chemistry, Faculty of Pharmacy in Hradec Králové, Charles University, Czech Republic)

12:40 M08: A new MS-Cleavable Cross-linker for studying Protein-Protein Interactions

• Swati Banerjee (Institute of Organic Chemistry and Biochemistry of the CAS/Department of Analytical Chemistry, Charles University)

12:48 M09: Proteomics Data Analysis: User-Friendly Software

• Alvaro Sanchez-Villalba (Proteomics Service Laboratory, Institute of Physiology)

12:56 M10: Stanovení proteinů z vína pomocí MALDI TOF MS

• Zdeněk Perutka (Katedra biochemie, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Palackého v Olomouci)

13:04 M11: Studium vlivu Acremonium alternatum na proteom rostlin Arabidopsis thaliana

• Veronika Berková (Ústav molekulární biologie a radiobiologie)

13:12 M12: Proč brambora ztratila šlechtěním rezistenci?

• Martin Černý (Ústav molekulární biologie a radiobiologie, Agronomická fakulta, Mendelova univerzita v Brně)

13:20 - 13:25 Závěr

13:30 Oběd v restauraci U děravýho kotle (pro registrované)