Mnova Screen
Brožury a specifikace | | SciY/Mestrelab ResearchInstrumentace
Fragmentové skríningy řízené ligandem pomocí NMR jsou klíčové pro identifikaci slabě vázajících fragmentů, které mohou být základem pro další optimalizaci v raných fázích vývoje léčiv. Automatizace tohoto procesu významně zrychluje vyhodnocení dat, zlepšuje reprodukovatelnost výsledků a umožňuje zpracování rozsáhlých knihoven fragmentů v krátkém čase.
Popis softwarového nástroje Mnova Screen, který automatizuje detekci „hitů“ ve fragmentovém skríningu s využitím ligandově detekovaných NMR experimentů. Hlavním cílem je nabídnout rychlý a uživatelsky přívětivý workflow pro analýzu dat z experimentů STD, waterLOGSY, T1ρ a CPMG pro jádra 1H i 19F.
Mnova Screen podporuje zpracování syrových i předzpracovaných dat z různých NMR platforem:
Software dokáže automaticky přiřadit spektra k jednotlivým vzorkům na základě Master Data File ve formátu JSON a rozpoznat slabé i překryté signály díky dekonvolučním algoritmům. V testech na datech z univerzitního i průmyslového prostředí byly úspěšně detekovány specifické i nespecifické hity, což je potvrzeno rozdílným chováním intenzit v přítomnosti inhibičních sloučenin.
Rostoucí objem dat a kombinace NMR skríningů s výpočetní vazbou (docking, AI-modely) otevírají možnosti pro pokročilé vícerozměrné analýzy. Integrace cloudových platforem a zpracování ve vysokém výkonu (HPC) umožní škálovat proces na tisíce fragmentů. Dále se očekává rozšíření podpory pro automatické generování reportů a propojení s LIMS systémy.
Mnova Screen představuje komplexní a modulární řešení pro fragmentově řízený NMR skríning. Nabízí rychlou detekci hitů, vysokou přesnost analytických výstupů a snadnou integraci do existujících workflow v akademických i průmyslových laboratořích.
V textu nejsou uvedeny explicitní citace literatury.
Software, NMR
ZaměřeníOstatní
VýrobceSciY/Mestrelab Research
Souhrn
Význam tématu
Fragmentové skríningy řízené ligandem pomocí NMR jsou klíčové pro identifikaci slabě vázajících fragmentů, které mohou být základem pro další optimalizaci v raných fázích vývoje léčiv. Automatizace tohoto procesu významně zrychluje vyhodnocení dat, zlepšuje reprodukovatelnost výsledků a umožňuje zpracování rozsáhlých knihoven fragmentů v krátkém čase.
Cíle a přehled studie
Popis softwarového nástroje Mnova Screen, který automatizuje detekci „hitů“ ve fragmentovém skríningu s využitím ligandově detekovaných NMR experimentů. Hlavním cílem je nabídnout rychlý a uživatelsky přívětivý workflow pro analýzu dat z experimentů STD, waterLOGSY, T1ρ a CPMG pro jádra 1H i 19F.
Použitá metodika a instrumentace
Mnova Screen podporuje zpracování syrových i předzpracovaných dat z různých NMR platforem:
- Jádra: 1H, 19F
- Experimenty: STD, waterLOGSY, T1ρ, CPMG
- Vstup: jednotlivé sloučeniny i směsi, data s/bez referenčních spekter
- Dodavatelé přístrojů: Bruker, Varian/Agilent, JEOL, JCAMP
Hlavní výsledky a diskuse
Software dokáže automaticky přiřadit spektra k jednotlivým vzorkům na základě Master Data File ve formátu JSON a rozpoznat slabé i překryté signály díky dekonvolučním algoritmům. V testech na datech z univerzitního i průmyslového prostředí byly úspěšně detekovány specifické i nespecifické hity, což je potvrzeno rozdílným chováním intenzit v přítomnosti inhibičních sloučenin.
Přínosy a praktické využití metody
- Zvýšení propustnosti dat: hromadná analýza stovek spekter během minut
- Zlepšená přesnost: dekonvoluce slabých signálů redukuje falešně negativní nálezy
- Flexibilita: podpora více experimentálních režimů a jáder, export do statistických balíků
- Jednoduchá integrace: přímé načítání Bruker FBS Master Data Files
Budoucí trendy a možnosti využití
Rostoucí objem dat a kombinace NMR skríningů s výpočetní vazbou (docking, AI-modely) otevírají možnosti pro pokročilé vícerozměrné analýzy. Integrace cloudových platforem a zpracování ve vysokém výkonu (HPC) umožní škálovat proces na tisíce fragmentů. Dále se očekává rozšíření podpory pro automatické generování reportů a propojení s LIMS systémy.
Závěr
Mnova Screen představuje komplexní a modulární řešení pro fragmentově řízený NMR skríning. Nabízí rychlou detekci hitů, vysokou přesnost analytických výstupů a snadnou integraci do existujících workflow v akademických i průmyslových laboratořích.
Reference
V textu nejsou uvedeny explicitní citace literatury.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Mnova BioHOS
|SciY/Mestrelab Research|Aplikace
Mnova BioHOS Application Note Mnova BioHOS Application Note Therapeutic pharmaceuticals (drugs) have witnessed a sea change in recent years. The large, dominant group of drugs derived from synthetic, small molecules has been joined by a new type of drug that…
Klíčová slova
compostela, compostelasantiago, santiagospain, spainbiohos, biohosmnova, mnovaccsd, ccsdfingerprinting, fingerprintingsee, seeechos, echosspectra, spectranotion, notionvery, veryinteractivity, interactivitymestrelab, mestrelabclose
Using Mnova Screen to Process, Analyze and Report Ligand-Protein Binding Spectra for Fragment-based Lead Design
2014|SciY/Mestrelab Research|Prezentace
September 2014 Using Mnova Screen to Process, Analyze and Report Ligand-Protein Binding Spectra for Fragment-based Lead Design Dr Manuel Perez Senior VP - Mestrelab • 1996: A research project in University of Santiago de Compostela, Spain, developed free MestReC software…
Klíčová slova
mnova, mnovaspectra, spectraref, refscout, scoutnmr, nmrmixture, mixturestd, stdpeaks, peakssaved, savedfolder, folderscreen, screenprocessing, processingtrinomial, trinomialnames, namesdata
Automated qNMR data processing and analysis in the behind-the-scenes of fragment-based drug discovery
|SciY/Mestrelab Research|Ostatní
Bringing new drugs into the market is a complex and long process that often requires several years of investigation and considerable human, technological, and economic resources. In the labs of the Cancer Research UK Cancer Therapeutics Unit at The Institute…
Klíčová slova
mnova, mnovaqnmr, qnmrgears, gearssops, sopshas, hasupscale, upscalesolubility, solubilityteam, teamscreening, screeningfbdd, fbddspectroscopists, spectroscopistsdiscovery, discoveryhyperlinks, hyperlinksmgears, mgearsallowed
Mnova Suite Tutorial
2022|SciY/Mestrelab Research|Manuály
Mnova Suite Tutorial NMR NMRPredict MSChrom Updated on 12/24/2022 • Open and process 1D and 2D NMR data • Multiplet analysis for 1D 1H NMR • Assign 1D peaks to a structure • Assign 1D and 2D spectra • Report…
Klíčová slova
multiplet, multipletclick, clickmnova, mnovadisplay, displaypress, pressdrag, dragassignments, assignmentsspectrum, spectrummultiplets, multipletspeaks, peakschange, changelicense, licensespectra, spectrachoose, choosepeak
