Quantification of mammalian gDNA
Aplikace | 2020 | Unchained LabsInstrumentace
Přesná kvantifikace genomové DNA (gDNA) je zásadní v molekulární biologii, klinické diagnostice a průmyslové analytice. Spolehlivé stanovení koncentrace gDNA zajišťuje správné nastavení experimentů, kvalitu výsledků a minimalizuje chyby způsobené kontaminanty absorbujícími v UV/VIS oblasti.
Tento application note popisuje použití aplikace DNA mammalian na analyzátorech Lunatic a Little Lunatic. Cílem je demonstrovat, jak prostřednictvím algoritmu Unmix izolovat spektrální složku dsDNA z celkového UV/VIS spektra a stanovit její koncentraci nezávisle na přítomnosti koabsorberů.
Unmix aplikace na systémech Lunatic a Little Lunatic nabízí robustní, rychlý a přesný způsob kvantifikace gDNA. Dekonvoluční přístup minimalizuje vliv koabsorberů a poskytuje výsledky blíže referenčním metodám, což podporuje efektivitu laboratorních analytických procesů.
UV–VIS Spektrofotometrie, Charakterizace částic
ZaměřeníProteomika
VýrobceUnchained Labs
Souhrn
Význam tématu
Přesná kvantifikace genomové DNA (gDNA) je zásadní v molekulární biologii, klinické diagnostice a průmyslové analytice. Spolehlivé stanovení koncentrace gDNA zajišťuje správné nastavení experimentů, kvalitu výsledků a minimalizuje chyby způsobené kontaminanty absorbujícími v UV/VIS oblasti.
Cíle a přehled studie / článku
Tento application note popisuje použití aplikace DNA mammalian na analyzátorech Lunatic a Little Lunatic. Cílem je demonstrovat, jak prostřednictvím algoritmu Unmix izolovat spektrální složku dsDNA z celkového UV/VIS spektra a stanovit její koncentraci nezávisle na přítomnosti koabsorberů.
Použitá metodika a instrumentace
- Instrumentace: analyzátory Lunatic a Little Lunatic společnosti Unchained Labs.
- Metoda Unmix: analýza tvaru UV/VIS spektra, dekonvoluce na komponenty dsDNA, nečistoty a pozadí.
- Blank: čistá voda k odstranění pozadí.
- Referenční metoda: fluorescenční PicoGreen assay (Thermo Fisher Scientific) pro ověření obsahu dsDNA.
Hlavní výsledky a diskuse
- Unmix aplikace identifikovala tři hlavní složky: zelený profil dsDNA (40–45 %GC), modré spektrum nečistot (RNA, soli, fenol) a šedé pozadí (turbidity, hemoglobin).
- Hodnoty dsDNA z Unmix aplikace korelovaly s PicoGreen assay přesněji než tradiční měření A260, u kterého dochází k nadhodnocení při přítomnosti příměsí.
- Případové studie ukázaly schopnost metody detekovat residualní soli z extrakčních činidel (peak A230) i vysoký obsah RNA v buněčných extraktech.
Přínosy a praktické využití metody
- Zrychlení a automatizace stanovení gDNA koncentrace bez nutnosti časově náročných barvivých assay.
- Snížení vlivu UV/VIS-absorbujících kontaminantů díky spektrální dekonvoluci.
- Široká kompatibilita s různými typy vzorků (krev, sliny, tkáňové kultury).
- Generování flexibilních reportů ve formátech HTML, PDF, XLSX, CSV aj.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Integrace výsledků s LIMS pro vyšší automatizaci laboratorních procesů.
- Rozšíření spektrálních algoritmů o strojové učení pro pokročilé odstraňování interferencí.
- Možnost aplikace na další biomolekuly (RNA, proteiny) a multiplexní měření.
Závěr
Unmix aplikace na systémech Lunatic a Little Lunatic nabízí robustní, rychlý a přesný způsob kvantifikace gDNA. Dekonvoluční přístup minimalizuje vliv koabsorberů a poskytuje výsledky blíže referenčním metodám, což podporuje efektivitu laboratorních analytických procesů.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Quantification of total nucleic acids from unknown sources (DNA eq)
2020|Unchained Labs|Aplikace
Application Note Quantification of total nucleic acids from unknown sources (DNA eq) Introduction In this note, we describe how to use the Nucleic Acids (DNA equiv.) application on the Lunatic systems. This Unmix application is used to analyze the UV/Vis…
Klíčová slova
unmix, unmixapp, appdna, dnanucleic, nucleicdetailing, detailingvis, visreported, reportedunknown, unknownacids, acidsbackground, backgroundspectral, spectralrrse, rrsethreshold, thresholdtotal, totalsources
Quantification of purified PCR samples
2020|Unchained Labs|Aplikace
Application Note Quantification of purified PCR samples Introduction In this note, we describe how to use the Purified PCR application on the Lunatic systems. This Unmix application is used to analyze the UV/Vis spectral shape of the sample to isolate…
Klíčová slova
unmix, unmixapp, apppcr, pcrpurified, purifiedquantification, quantificationnucleic, nucleicspectral, spectralimage, imagesamples, samplesrrse, rrsevis, visshown, shownfluorescence, fluorescenceunderestimates, underestimatesphage
Quantification of total nucleic acids from unknown sources (RNA eq)
2020|Unchained Labs|Aplikace
Application Note Quantification of total nucleic acids from unknown sources (RNA eq) Introduction In this note, we describe how to use the Nucleic Acids (RNA equiv.) application on the Lunatic systems. This Unmix application is used to analyze the UV/Vis…
Klíčová slova
unmix, unmixapp, appnucleic, nucleicrna, rnadetailing, detailingvis, visreported, reportedunknown, unknownacids, acidsbackground, backgroundspectral, spectralrrse, rrsethreshold, thresholdtotal, totalsources
Fast & accurate DNA quantification with Lunatic
2020|Unchained Labs|Technické články
Technical Note Fast & accurate DNA quantification with Lunatic Introduction A Fluorescent dye-based assays are one of the predominant methods for quantifying nucleic acids, but they’re bogged down by a lot of steps. If anything goes wrong along the way,…
Klíčová slova
lunatic, lunaticdna, dnanucleic, nucleicquadruplicate, quadruplicatefluorescent, fluorescentqubit, qubitpicogreen, picogreenunmix, unmixdsdna, dsdnaspectrum, spectrumvis, visquantification, quantificationacid, acidline, lineconcentration
