Wiley vydal AntiBase Library 2024 - nejnovější verzi Wileyho knihovny pro identifikaci přírodních látek

Knihovna The Wiley Identifier of Natural Products (AntiBase Library + ChemWindow®) je komplexní databáze přírodních látek pro screening a další aplikace ve výzkumu sloučenin z přírodních zdrojů.

Proslulá knihovna AntiBase Library, kterou původně vyvinul Dr. Hartmut Laatsch, obsahuje více než 95 800 sloučenin. A v poslední verzi jsme přidali o 60 % více sloučenin!

Tato rostoucí databáze, široce citovaná ve vědecké literatuře, je účinným skríningovým nástrojem pro metabolomiku a objevování léčiv, kde přírodní látky a jejich deriváty mohou urychlit léčbu rakoviny, cukrovky, výzkum nemocí či antimikrobiální nebo antimykotický výzkum.

Knihovna nyní obsahuje Wiley's ChemWindow software pro bezpečné vyhledávání a výkonné nástroje pro vytváření vlastních databází, kreslení struktur a další.

Wiley: AntiBase Library – Wiley Identifier of Natural Products: přehled.

Využití

• Začlenění do testování s vysokou propustností (HTS) a dereplikačních pracovních postupů ve farmacii a biotechnologiích umožňuje rychlou identifikaci již studovaných sloučenin s cílem zefektivnit hledání nových sloučenin s antimikrobiálními nebo jinými požadovanými účinky.
• Využití v různých průmyslových odvětvích, jako jsou potravinářství a kosmetika, zemědělství, pesticidy a další aplikace, kde převažují přírodní produkty, nebo v akademických výzkumných programech.

Co je nového ve verzi 2024.

• Rozšířili jsme kolekci o více než 60 % a přidali 37 000 nových sloučenin, včetně sloučenin z databáze The Natural Products Atlas.
• Do databáze byla přidána vypočtená IČ a CNMR spektra
• Byly přidány užitečné odkazy na další známé zdroje včetně ZINC, KEGG a ChEMBL.

Důvěryhodná data z důvěryhodného zdroje

Wiley je uznávanou autoritou mezi zdroji vědeckých dat. Naše renomované databáze jsou zpracovávány podle přísných protokolů, které zajišťují jejich nejvyšší kvalitu. Kvalifikační postupy začínají při pořizování dat a pokračují v celém procesu vývoje databáze. Veškerá data získaná od důvěryhodných partnerů jsou před zařazením do našich kolekcí ještě důkladně prověřena.

Klíčové vlastnosti

Pečlivě zpracovaná a ověřená data

Data jsou shromažďována z primární a sekundární literatury, a poté jsou pečlivě kontrolována a ověřována. Kklíčové odkazy a zdrojová data jsou uvedena ve formě datových polí.

Důležitá metadata, která vám pomohou zúžit výsledky.

Kromě chemických struktur obsahují záznamy metadata s možností vyhledávání, pokud jsou k dispozici:

• Vlastnosti sloučeniny, jako je molekulový vzorec, hmotnost, složení, třída, zeměpisná poloha, bod tání, optická otáčivost a další.
• Údaje o biologické aktivitě
• Pohodlné odkazy na související zdroje, jako jsou DOI literatury, Human Metabolome Database (HMDB), ZINC, KEGG, ChEMBL.

Spektrální data pro pomoc při charakterizaci

• AntiBase nyní poskytuje přístup k více než 17 tisícům infračervených a více než 41 tisícům ¹³C NMR spekter (vypočtených pomocí naměřených referenčních spekter společnosti Wiley a vlastních technologií AI).
• Záznamy obsahují také data píků pro více technik včetně IR, HRMS, MS, UV, HNMR

Užitečné odkazy přímo na související reference.

Rychlý přístup k souvisejícím referencím pro snadné použití: Odkaz na literaturu DOI, Human Metabolome Database (HMDB), ZINC, KEGG, ChEMBL.

Výkonné nástroje pro dolování dat a tvorbu databází

Databáze je dodávána s Wiley's ChemWindow software pro vyhledávání ve sbírce a výkonné nástroje pro vytváření vlastních databází, kreslení struktur a další.

Pokrytí sloučenin

Databáze obsahuje sloučeniny z těchto biologických zdrojů:

• Řasy
• Živočichové
• Bakterie
• Sinice
• Dinoflageláty
• Houby
• Lišejníky
• Myxobakterie
• Rostliny
• Prvoci
• plísně
• Kvasinky

Wiley: AntiBase Library - Wiley Identifier of Natural Products: pokrytí sloučenin

Specifikace knihovny

• Přírodní látky: 95,840
• Chemické struktury: 92,832
• Údaje o klasifikaci sloučenin: 24 366
• Údaje o zdroji/původu: 92,269/ 11,159
• Údaje o biologické aktivitě: 34,292
• Hodnoty optické rotace: 16,442
• Údaje o bodu tání: 7,067
• Údaje o pících v MS: 10,089
• Údaje o pících v infračervených spektrech: 11,502
• Předikovaná IR spektra: 17 732
• Údaje o pících v H-NMR: 2 211
• Údaje o pících v C-NMR: 17,927
• Předikovaná C-NMR spektra: 41 760
• Údaje o pících v UV: 17,397
• Literární odkazy: 95,170
• HMDB Odkazy: 95,95 2,216
• ZINC Odkazy: 1,848
• KEGG odkazy: 755
• ChEMBL Odkazy: 7,288

Kompatibilita

Knihovna Wiley Identifier of Natural Productsobsahuje je dodávána se softwarem KnowItAll ChemWindow Edition, s kterým je plně kompatibilní. Zárověň ji lze používat i s jinými edicemi softwaru KnowItAll.

Literární příklady využití použití knihovny AntiBase Library

v Google Scholar existuje více než 1500 odkazů na knihovnu AntiBase Library. Zde je několik z mnoha příkladů, jak vědci tuto databázi využívají v různých aplikacích.

Discovery of actinomycin L, a new member of the actinomycin family of antibiotics.¹

Summary: Streptomycetes produce bioactive natural products, including a majority of naturally produced antibiotics. Two new actinomycin analogues produced by Streptomyces sp. MBT27, actinomycin L1 and L2, have been discovered. Dereplication was performed using Reaxys, ChemSpider, and AntiBase. Mass features of existing natural products were annotated while one mass feature with an m/z value of 1387.6706 [M + H]+ could not be matched to any previously reported natural products.

New Metabolites From the Endophytic Fungus Cercophora samala Associated With Mitragyna inermis.²

Summary: Mitragyna inermis is a small tree species that grows in West Africa that has been used in traditional medicine to treat a number of conditions. Two new metabolites from this tree species have been isolated and have had their structures elucidated by comparison of their spectroscopic data with those reported in AntiBase and by DFT calculations.

Combination of high-throughput microfluidics and FACS technologies to leverage the numbers game in natural product discovery.³

Summary: To facilitate the discovery of natural products, a screening method was developed using a combination of droplet microfluidics and fluorescence-activated cell sorting-based technologies. This method was utilized to assess a microbial environmental sample. To identify the natural products, molecular formula searches were performed using AntiBase.