Optimizing tissue preparation and storage for analysis of polyunsaturated fatty acids using Agilent’s FTIR imaging systems
Aplikace | 2014 | Agilent TechnologiesInstrumentace
Analýza polynenasycených mastných kyselin v biologických tkáních je nezbytná pro pochopení jejich role v patologických stavech včetně neurodegenerativních onemocnění. Fourierova transformace infračervené spektroskopie (FTIR) s vysokým prostorovým rozlišením umožňuje lokalizovat a kvantifikovat PUFA na subbuněčné úrovni, přičemž správná příprava a skladování vzorků zásadně ovlivňuje přesnost výsledků.
Cílem této studie bylo definovat podmínky přípravy a skladování tenkých řezů sítnice, které minimalizují oxidativní degradaci nenasycených vazeb PUFA. Autoři sledovali pokles charakteristických absorpčních pásů C=C-H a C=O při běžném i urychleném vystavení světlu a pokojové teplotě a navrhli doporučené protokoly pro spolehlivé FTIR zobrazování.
Vzorky
Pod urychlenými podmínkami (denní světlo, pokojová teplota) došlo k téměř úplné eliminaci PUFA signálu do 48 hodin. Při běžném skladování v temnu a při pokojové teplotě byla ztráta méně dramatická, avšak pozorovatelná:
Optimalizovaný protokol přípravy a skladování zaručuje věrné spektrální znázornění PUFA bez významného šumu z oxidace. Výsledky pomáhají laboratořím definovat maximální interval mezi rozmražením a měřením, což je klíčové pro přesnou kvantifikaci v biomedicínském výzkumu i průmyslové QA/QC.
Studie potvrdila, že i při standardním skladování v temnu a suchu dochází k významné oxidativní degradaci PUFA ve tkáňových řezech již během několika týdnů. Pro co nejpřesnější FTIR analýzu je nutné provést měření bezprostředně po rozmražení a důsledně eliminovat vystavení vzorků světlu.
FTIR Spektroskopie, Mikroskopie
ZaměřeníKlinická analýza
VýrobceAgilent Technologies
Souhrn
Význam tématu
Analýza polynenasycených mastných kyselin v biologických tkáních je nezbytná pro pochopení jejich role v patologických stavech včetně neurodegenerativních onemocnění. Fourierova transformace infračervené spektroskopie (FTIR) s vysokým prostorovým rozlišením umožňuje lokalizovat a kvantifikovat PUFA na subbuněčné úrovni, přičemž správná příprava a skladování vzorků zásadně ovlivňuje přesnost výsledků.
Cíle a přehled studie / článku
Cílem této studie bylo definovat podmínky přípravy a skladování tenkých řezů sítnice, které minimalizují oxidativní degradaci nenasycených vazeb PUFA. Autoři sledovali pokles charakteristických absorpčních pásů C=C-H a C=O při běžném i urychleném vystavení světlu a pokojové teplotě a navrhli doporučené protokoly pro spolehlivé FTIR zobrazování.
Použitá metodika a instrumentace
Vzorky
- Sítnice z 13 měsíců staré myši C57BL/6, kryosekce tloušťky 7 μm
- Zmrazení v isopentanu ochlazeném v dusíku a skladování při –70 °C
- Agilent Cary 670 FTIR spektrometr spojený s mikroskopem Cary 620
- FPA detektor 64×64 pixelů, rozlišení 5,5 μm na pixel
- Režimy reflekce (MirrIR) a průchodu (BaF2)
- Spektra 4000–900 cm⁻¹, rozlišení 4 cm⁻¹, 256 akumulovaných skenů
- Olefinický C=C–H při 3012 cm⁻¹
- Lipidový karbonyl C=O při 1735 cm⁻¹
Hlavní výsledky a diskuse
Pod urychlenými podmínkami (denní světlo, pokojová teplota) došlo k téměř úplné eliminaci PUFA signálu do 48 hodin. Při běžném skladování v temnu a při pokojové teplotě byla ztráta méně dramatická, avšak pozorovatelná:
- Pokles ~8 % intenzity pásu C=C–H během prvních 14 dnů
- Cca 15 % úbytek po jednom měsíci
- Do osmi měsíců zbylo méně než třetina původní koncentrace PUFA
Přínosy a praktické využití metody
Optimalizovaný protokol přípravy a skladování zaručuje věrné spektrální znázornění PUFA bez významného šumu z oxidace. Výsledky pomáhají laboratořím definovat maximální interval mezi rozmražením a měřením, což je klíčové pro přesnou kvantifikaci v biomedicínském výzkumu i průmyslové QA/QC.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Vývoj ochranných nástřiků nebo stabilizačních činidel zabraňujících oxidaci
- Rozšíření metodiky na další typy tkání a lipidů
- Integrace s pokročilou chemickou zobrazovací analýzou a strojovým učením pro automatizované rozpoznávání biomarkerů
- Použití kryogenní FTIR mikroskopie pro další omezení degradace
Závěr
Studie potvrdila, že i při standardním skladování v temnu a suchu dochází k významné oxidativní degradaci PUFA ve tkáňových řezech již během několika týdnů. Pro co nejpřesnější FTIR analýzu je nutné provést měření bezprostředně po rozmražení a důsledně eliminovat vystavení vzorků světlu.
Reference
- Fraser T, Taylor H, Love S Neurochem Res 35 503–513 2010
- Hartmann T, Kuchenbecker J, Grimm MOW J Neurochem 103 159–170 2007
- Stitt DM, Kastyak-Ibrahim MZ, Liao CR, Morrison J, Albensi BC, Gough KM Vib Spectrosc 60 16–22 2012
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
High Spatial resolution FTIR imaging of biomedical tissue samples using a novel method of magnification enhancement
2014|Agilent Technologies|Aplikace
High Spatial resolution FTIR imaging of biomedical tissue samples using a novel method of magnification enhancement Application note Biomedical Research Authors Mustafa Kansiz1, Carol Hirschmugl2, Benedict Albensi3, Catherine Liao4, Kathleen Gough4 1 Agilent Technologies Australia Pty Ltd, Mulgrave, Australia 2…
Klíčová slova
magnification, magnificationsynchrotron, synchrotronabsorbance, absorbancespatial, spatialireni, irenipixel, pixelglobar, globarftir, ftirimaging, imagingagilent, agilentsource, sourcehigh, highmicroscope, microscopebiomedical, biomedicalstandard
Rapid screening of brain tissue with a high spatial resolution over large analysis areas using Agilent’s 670 and 620 FTIR imaging analysis
2012|Agilent Technologies|Aplikace
Rapid screening of brain tissue with a high spatial resolution over large analysis areas using Agilent’s 670 and 620 FTIR imaging analysis Application note Biomedical Authors Kathleen M. Gough*, Alexandra Kuzyk*, Jonah Kirkwood† * Department of Chemistry University of Manitoba…
Klíčová slova
imaging, imagingmosaic, mosaicbrain, brainplaques, plaquesspatial, spatialtissue, tissueresolutions, resolutionsagilent, agilentchemical, chemicalresolution, resolutiontangles, tanglesinfrared, infraredinvestigate, investigatemanitoba, manitobaunderstanding
Polymers and Rubbers Application Compendium
2010|Agilent Technologies|Příručky
MATERIALS TESTING AND RESEARCH SOLUTIONS FROM AGILENT Polymers and Rubbers Application Compendium AGILENT TECHNOLOGIES MATERIALS TESTING AND RESEARCH SOLUTIONS From the extraction of raw materials through the development, manufacturing and utilization of advanced materials, to material reuse and recycling, Agilent…
Klíčová slova
kfm, kfmsurface, surfaceforce, forceafm, afmmodulus, modulustopography, topographyimages, imagesimaging, imagingpolymer, polymerscratch, scratchsample, samplepotential, potentialprobe, probefrom, frommeasurements
FTIR Microscopic Imaging of Large Samples with 4x and 15x Infrared Objectives: A Case Study of a Carcinoma Tissue Section
2014|Agilent Technologies|Aplikace
FTIR Microscopic Imaging of Large Samples with 4x and 15x Infrared Objectives: A Case Study of a Carcinoma Tissue Section Application note Biomedical Research Author Claudia Beleites*, Jürgen Popp*, Christoph Krafft*, Mustafa Kansiz† * Institute of Photonic Technology, Albert-Einstein-Str. 9,…
Klíčová slova
tissue, tissuecarcinoma, carcinomamosaic, mosaicsize, sizeftir, ftirfile, filemosaics, mosaicspixel, pixelfov, fovfpa, fpadata, dataimages, imagessection, sectionfive, fivemicroscopic