Quantification of total protein content
Aplikace | 2020 | Unchained LabsInstrumentace
Analytická kvantifikace celkového obsahu bílkovin v komplexních vzorcích je klíčová pro biochemické a biotechnologické aplikace. Přesné stanovení koncentrace umožňuje validaci přípravy vzorků, kontrolu kvality extrakčních a purifikačních procesů a optimalizaci laboratorních protokolů.
Cílem předkládané aplikace je ukázat využití softwarového modulu Unmix na systémových zařízeních Lunatic a Little Lunatic k izolaci spektrálního příspěvku bílkovin z UV/Vis absorpčního spektra. Studie demonstruje postup analýzy, detekci interferujících složek a výpočet koncentrace pomocí definovaného extinkčního koeficientu.
Pro analýzu se používají přístroje Lunatic a Little Lunatic vybavené Unmix aplikací. Metoda založená na dekonvoluci UV/Vis spektra rozlišuje tři komponenty:
Jako blank se používá čistá voda. Uživatel zadává hodnotu E1% (výchozí 10).
Unmix aplikace úspěšně odděluje spektrální složky a vypočítává koncentraci bílkovin. Kvalita fitu je hodnocena metrikou RRSE (residual relative squared error); hodnota nad 5 % signalizuje nekvalitní měření způsobené vysokým zakalením, neznámými látkami nebo nízkou koncentrací. Aplikace umožňuje generovat výstupy ve formátech HTML, XML, TXT a CSV (Lunatic navíc XLSX a PDF).
Metoda poskytuje rychlou, automatizovanou a objektivní kvantifikaci bílkovin ve vzorcích s přítomností rušivých látek. Díky rozlišení jednotlivých složek lze monitorovat čistotu vzorků, optimalizovat purifikační protokoly a zajistit konzistentní kontrolu kvality v laboratoři.
Očekává se rozšíření využití algoritmů strojového učení ke zlepšení dekonvoluce složitých spekter a rozšíření databáze spektrálních modelů specifických biomolekul. Integrace s datovými platformami a online monitoring umožní real-time kontrolu procesů ve výrobě biotechnologických produktů.
Unmix aplikace na platformě Lunatic představuje efektivní nástroj pro kvantifikaci celkového obsahu bílkovin ve složitých vzorcích. Díky schopnosti rozpoznat a odečíst rušivé složky dosahuje přesných výsledků vhodných pro výzkum i průmyslovou analytiku.
V textu nebyly uvedeny explicitní bibliografické odkazy.
Charakterizace částic, UV–VIS Spektrofotometrie
ZaměřeníProteomika
VýrobceUnchained Labs
Souhrn
Význam tématu
Analytická kvantifikace celkového obsahu bílkovin v komplexních vzorcích je klíčová pro biochemické a biotechnologické aplikace. Přesné stanovení koncentrace umožňuje validaci přípravy vzorků, kontrolu kvality extrakčních a purifikačních procesů a optimalizaci laboratorních protokolů.
Cíle a přehled studie / článku
Cílem předkládané aplikace je ukázat využití softwarového modulu Unmix na systémových zařízeních Lunatic a Little Lunatic k izolaci spektrálního příspěvku bílkovin z UV/Vis absorpčního spektra. Studie demonstruje postup analýzy, detekci interferujících složek a výpočet koncentrace pomocí definovaného extinkčního koeficientu.
Použitá metodika a instrumentace
Pro analýzu se používají přístroje Lunatic a Little Lunatic vybavené Unmix aplikací. Metoda založená na dekonvoluci UV/Vis spektra rozlišuje tři komponenty:
- Bílkoviny: stanovení koncentrace z absorpčního maxima při 280 nm a definovaného extinkčního koeficientu (E1%).
- Nečistoty: identifikace nukleových kyselin, azidu, proteázových inhibitorů, polysacharidů a detergentů absorbujících v UV/Vis oblasti.
- Pozadí: profil zákalu vzorku, který je odečten od původního spektra.
Jako blank se používá čistá voda. Uživatel zadává hodnotu E1% (výchozí 10).
Hlavní výsledky a diskuse
Unmix aplikace úspěšně odděluje spektrální složky a vypočítává koncentraci bílkovin. Kvalita fitu je hodnocena metrikou RRSE (residual relative squared error); hodnota nad 5 % signalizuje nekvalitní měření způsobené vysokým zakalením, neznámými látkami nebo nízkou koncentrací. Aplikace umožňuje generovat výstupy ve formátech HTML, XML, TXT a CSV (Lunatic navíc XLSX a PDF).
Přínosy a praktické využití metody
Metoda poskytuje rychlou, automatizovanou a objektivní kvantifikaci bílkovin ve vzorcích s přítomností rušivých látek. Díky rozlišení jednotlivých složek lze monitorovat čistotu vzorků, optimalizovat purifikační protokoly a zajistit konzistentní kontrolu kvality v laboratoři.
Budoucí trendy a možnosti využití
Očekává se rozšíření využití algoritmů strojového učení ke zlepšení dekonvoluce složitých spekter a rozšíření databáze spektrálních modelů specifických biomolekul. Integrace s datovými platformami a online monitoring umožní real-time kontrolu procesů ve výrobě biotechnologických produktů.
Závěr
Unmix aplikace na platformě Lunatic představuje efektivní nástroj pro kvantifikaci celkového obsahu bílkovin ve složitých vzorcích. Díky schopnosti rozpoznat a odečíst rušivé složky dosahuje přesných výsledků vhodných pro výzkum i průmyslovou analytiku.
Reference
V textu nebyly uvedeny explicitní bibliografické odkazy.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Quantification of total nucleic acids from unknown sources (DNA eq)
2020|Unchained Labs|Aplikace
Application Note Quantification of total nucleic acids from unknown sources (DNA eq) Introduction In this note, we describe how to use the Nucleic Acids (DNA equiv.) application on the Lunatic systems. This Unmix application is used to analyze the UV/Vis…
Klíčová slova
unmix, unmixapp, appdna, dnanucleic, nucleicdetailing, detailingvis, visreported, reportedunknown, unknownacids, acidsbackground, backgroundspectral, spectralrrse, rrsethreshold, thresholdtotal, totalsources
Quantification of total nucleic acids from unknown sources (RNA eq)
2020|Unchained Labs|Aplikace
Application Note Quantification of total nucleic acids from unknown sources (RNA eq) Introduction In this note, we describe how to use the Nucleic Acids (RNA equiv.) application on the Lunatic systems. This Unmix application is used to analyze the UV/Vis…
Klíčová slova
unmix, unmixapp, appnucleic, nucleicrna, rnadetailing, detailingvis, visreported, reportedunknown, unknownacids, acidsbackground, backgroundspectral, spectralrrse, rrsethreshold, thresholdtotal, totalsources
Quantification of purified PCR samples
2020|Unchained Labs|Aplikace
Application Note Quantification of purified PCR samples Introduction In this note, we describe how to use the Purified PCR application on the Lunatic systems. This Unmix application is used to analyze the UV/Vis spectral shape of the sample to isolate…
Klíčová slova
unmix, unmixapp, apppcr, pcrpurified, purifiedquantification, quantificationnucleic, nucleicspectral, spectralimage, imagesamples, samplesrrse, rrsevis, visshown, shownfluorescence, fluorescenceunderestimates, underestimatesphage
Quantification of mammalian gDNA
2020|Unchained Labs|Aplikace
Application Note Quantification of mammalian gDNA Introduction In this note, we describe how to use the DNA mammalian application on the Lunatic systems. This Unmix application is used to analyze the UV/Vis spectral shape of the sample to isolate the…
Klíčová slova
unmix, unmixgdna, gdnadna, dnamammalian, mammalianpicogreen, picogreenapp, appspectrum, spectrumdetailing, detailingvis, visnucleic, nucleicchemagen, chemagenchemagic, chemagicqiasymphony, qiasymphonyselection, selectionextracted