Direct and Traceable Mass Purity Certification of Protein Standards using LC-ICP-MS/MS
Aplikace | 2022 | Agilent TechnologiesInstrumentace
Analýza absolutního množství proteinů je klíčová pro spolehlivou kvantifikaci v proteomice, farmaceutickém výzkumu a klinických aplikacích. Přímé a stopovatelné certifikace hmotnostní čistoty proteinových standardů zajišťují kvalitu dat a umožňují mezinárodní srovnatelnost výsledků.
Studie představuje novou metodu pro přímou certifikaci hmotnostní čistoty proteinových standardů pomocí kapilární LC spojené s ICP-MS/MS. Porovnává dvě kalibrační strategie – vnitřní standardizaci S-obsažným standardem a externí standardizaci pomocí FIA s ICP-MS síranovým standardem – a hodnotí jejich přesnost a opakovatelnost.
Metoda byla ověřena na čtyřech proteinech (cytochrom C, β-casein, transferrin, BSA) s molekulovými hmotnostmi 12–66 kDa. Obě kalibrační strategie vykázaly srovnatelnou přesnost (standardní odchylky 1–6 %) a naměřené hmotnostní čistoty (92–99 %) se shodovaly s teoretickými hodnotami výrobců. Úplné eluční výtěžky a konzistentní odpovědi potvrzují platnost přístupu.
Metoda poskytuje přímou, citelnou a obecnou kvantifikaci proteinů bez nutnosti proteinově specifických standardů. Umožňuje certifikaci standardů pro QA/QC v biopharmaceutickém vývoji, klinických laboratořích i základním výzkumu proteomiky.
Očekává se rozšíření metody pro malé peptidy, posttranslační modifikace a další heteroatomy. Integrace s mikrofluidními systémy a automatizace přípravy vzorků zvýší throughput a uplatnění v průmyslových laboratořích.
CapLC-ICP-MS/MS umožňuje rychlou a stopovatelnou certifikaci hmotnostní čistoty proteinových standardů s vysokou přesností a reprodukovatelností. Obě kalibrační strategie jsou vhodné pro obecné použití v analytické chemii proteinů.
HPLC, ICP/MS, ICP/MS/MS
ZaměřeníProteomika
VýrobceAgilent Technologies
Souhrn
Význam tématu
Analýza absolutního množství proteinů je klíčová pro spolehlivou kvantifikaci v proteomice, farmaceutickém výzkumu a klinických aplikacích. Přímé a stopovatelné certifikace hmotnostní čistoty proteinových standardů zajišťují kvalitu dat a umožňují mezinárodní srovnatelnost výsledků.
Cíle a přehled studie / článku
Studie představuje novou metodu pro přímou certifikaci hmotnostní čistoty proteinových standardů pomocí kapilární LC spojené s ICP-MS/MS. Porovnává dvě kalibrační strategie – vnitřní standardizaci S-obsažným standardem a externí standardizaci pomocí FIA s ICP-MS síranovým standardem – a hodnotí jejich přesnost a opakovatelnost.
Použitá metodika a instrumentace
- Separace proteinů kapilárními kolonnami C4 (150×0,3 mm, 3,4 µm) v gradientu vody a acetonitrilu s 0,2 % kyseliny mravenčí při průtoku 3,5 µL/min.
- Detekce pomocí Agilent 8900 Triple Quadrupole ICP-MS v MS/MS režimu s metodou posunu hmotnosti S→SO (Q1 m/z 32, Q2 m/z 48).
- Vnitřní standardizace: BOC-L-methionin přidán přímo ke vzorku pro korekci injekční variability.
- Externí standardizace: FIA injekce certifikovaného ICP-MS síranového standardu provedené před chromatografií pro výpočet odezvy.
- Přidání CO2 do plazmy k potlačení kolísání odpovědi na síru způsobeného organickým gradientem.
Hlavní výsledky a diskuse
Metoda byla ověřena na čtyřech proteinech (cytochrom C, β-casein, transferrin, BSA) s molekulovými hmotnostmi 12–66 kDa. Obě kalibrační strategie vykázaly srovnatelnou přesnost (standardní odchylky 1–6 %) a naměřené hmotnostní čistoty (92–99 %) se shodovaly s teoretickými hodnotami výrobců. Úplné eluční výtěžky a konzistentní odpovědi potvrzují platnost přístupu.
Přínosy a praktické využití metody
Metoda poskytuje přímou, citelnou a obecnou kvantifikaci proteinů bez nutnosti proteinově specifických standardů. Umožňuje certifikaci standardů pro QA/QC v biopharmaceutickém vývoji, klinických laboratořích i základním výzkumu proteomiky.
Budoucí trendy a možnosti využití
Očekává se rozšíření metody pro malé peptidy, posttranslační modifikace a další heteroatomy. Integrace s mikrofluidními systémy a automatizace přípravy vzorků zvýší throughput a uplatnění v průmyslových laboratořích.
Závěr
CapLC-ICP-MS/MS umožňuje rychlou a stopovatelnou certifikaci hmotnostní čistoty proteinových standardů s vysokou přesností a reprodukovatelností. Obě kalibrační strategie jsou vhodné pro obecné použití v analytické chemii proteinů.
Reference
- Calderon-Celis F, Ruiz Encinar J, Sanz-Medel A. Standardization approaches in absolute quantitative proteomics with mass spectrometry. Mass Spectrom Rev., 2018, 37, 715–737.
- Wind M, Wegener A, Eisenmenger A, Kellner R, Lehmann WD. Sulfur as the key element for quantitative protein analysis by capillary liquid chromatography coupled to element mass spectrometry. Angew Chem Int Ed., 2003, 42, 3425–3427.
- Diez Fernández S, Sugishama N, Ruiz Encinar J, Sanz-Medel A. Triple Quad ICP-MS (ICP-QQQ) as a New Tool for Absolute Quantitative Proteomics and Phosphoproteomics. Anal Chem., 2012, 84, 5851–5857.
- Calderón-Celis F, Diez-Fernández S, Costa-Fernández JM, Ruiz Encinar J, Calvete JJC, Sanz-Medel A. Elemental Mass Spectrometry for absolute intact protein quantification without protein-specific standards: application to snake venomics. Anal Chem., 2016, 88, 9699–9706.
- Calderón-Celis F, Calvete JJC, Sanz-Medel A, Ruiz Encinar J. Absolute Quantification of Proteins in Snake Venom using capLC-ICP-QQQ and Online Isotope Dilution Analysis. Agilent publication, 5991-9016EN.
- Calderón-Celis F, Ruiz Encinar J, Sanz-Medel A. Enhanced Universal Quantification of Biomolecules Using Element MS and Generic Standards: Application to Intact Protein and Phosphoprotein Determination. Anal Chem., 2019, 91, 1105–1112.
- Cid-Barrio L, Calderón-Celis F, Costa-Fernández JM, Ruiz Encinar J. Assessment of the Potential and Limitations of Elemental Mass Spectrometry in Life Sciences for Absolute Quantification of Biomolecules Using Generic Standards. Anal Chem., 2020, 92, 13135–131508.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Absolute Quantification of Proteins in Snake Venom
2020|Agilent Technologies|Aplikace
Application Note Proteomics Absolute Quantification of Proteins in Snake Venom Using capLC-ICP-QQQ and online isotope dilution analysis Authors Francisco Calderon-Celis, Jorge Ruiz Encinar, Alfredo Sanz-Medel Department of Physical and Analytical Chemistry, University of Oviedo, Spain Juan Jose Calvete Instituto de…
Klíčová slova
venom, venomsvmp, svmpcaplc, caplcsulfur, sulfurqqq, qqqicp, icpquantification, quantificationintact, intactheteroelement, heteroelementabsolute, absolutesnake, snakeprotein, proteinproteins, proteinsida, idaisotope
Agilent ICP-MS Journal (August 2022, Issue 89)
2022|Agilent Technologies|Ostatní
Agilent ICP-MS Journal August 2022, Issue 89 Page 1 ICP-MS/MS Applications and New Elemental Impurity Methods and Guidelines Pages 2–3 In situ Sr Isotope Analysis and Rb-Sr Geochronology by LA-ICP-MS/MS ICP-MS/MS Applications and New Elemental Impurity Methods and Guidelines In…
Klíčová slova
icp, icpgeochronology, geochronologyelemental, elementalisotope, isotopestandardization, standardizationcannabis, cannabisguidelines, guidelinessitu, situanalysis, analysisagilent, agilentprotein, proteinelements, elementscutaneous, cutaneousimpurity, impuritymethod
Simultaneous quantification of peptides and phosphopeptides by capLC-ICP-MS using the Agilent 8800/8900 Triple Quadrupole ICP-MS
2016|Agilent Technologies|Aplikace
Simultaneous quantification of peptides and phosphopeptides by capLC-ICPMS using the Agilent 8800/8900 Triple Quadrupole ICP-MS Application note Proteomics Authors Silvia Diez Fernández1, Naoki Sugiyama2, Jorge Ruiz Encinar1, and Alfredo SanzMedel1 Department of Physical and Analytical Chemistry, University of Oviedo, Julián…
Klíčová slova
caplc, caplcicp, icpmicrolc, microlccontaining, containingabsolute, absoluteqms, qmspeptides, peptidesdls, dlssulfur, sulfurheteroatom, heteroatomcell, cellphosphopeptides, phosphopeptidesquantification, quantificationquantitation, quantitationremoval
Simultaneous Quantification of Peptides and Phosphopeptides by capLC-ICP-MS
2020|Agilent Technologies|Aplikace
Application Note Simultaneous Quantification of Peptides and Phosphopeptides by capLC-ICP-MS Trace measurement of phosphorus and sulfur using the Agilent 8800/8900 ICP-QQQ Introduction Authors Silvia Diez Fernández Jorge Ruiz Encinar1 Alfredo SanzMedel1 Naoki Sugiyama2 1 Department of Physical and Analytical Chemistry,…
Klíčová slova
caplc, caplcicp, icpmicrolc, microlcdls, dlssulfur, sulfurcontaining, containingqqq, qqqcell, cellphosphopeptides, phosphopeptidesqms, qmsphosphopeptide, phosphopeptideors, orscompound, compoundremoval, removalpeptides